MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016944	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739909
2	NC_016944	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739909
3	NC_016944	CAG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739909
4	NC_016944	GGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739909
5	NC_016944	TGA	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739909
6	NC_016944	GGT	2	6	749	754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739909
7	NC_016944	TGC	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739909
8	NC_016944	ATG	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739910
9	NC_016944	A	6	6	839	844	100 %	0 %	0 %	0 %	379739910
10	NC_016944	ATC	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739910
11	NC_016944	GTT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739910
12	NC_016944	GCTC	2	8	985	992	0 %	25 %	25 %	50 %	379739910
13	NC_016944	CGG	2	6	1009	1014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739910
14	NC_016944	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739910
15	NC_016944	CAA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739910
16	NC_016944	TGG	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739910
17	NC_016944	GC	3	6	1315	1320	0 %	0 %	50 %	50 %	379739910
18	NC_016944	T	6	6	1331	1336	0 %	100 %	0 %	0 %	379739910
19	NC_016944	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739910
20	NC_016944	GGT	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739910
21	NC_016944	CAC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739910
22	NC_016944	TTGG	2	8	1554	1561	0 %	50 %	50 %	0 %	379739910
23	NC_016944	ATG	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739910
24	NC_016944	TCT	3	9	1642	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739910
25	NC_016944	CCA	2	6	1700	1705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739910
26	NC_016944	ATCA	2	8	1779	1786	50 %	25 %	0 %	25 %	379739910
27	NC_016944	CGG	2	6	1894	1899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739910
28	NC_016944	GAC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739910
29	NC_016944	ATGA	2	8	1964	1971	50 %	25 %	25 %	0 %	379739910
30	NC_016944	GCGT	2	8	2060	2067	0 %	25 %	50 %	25 %	379739910
31	NC_016944	AAT	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379739910
32	NC_016944	ACC	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739910
33	NC_016944	TGT	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739910
34	NC_016944	ACTT	2	8	2269	2276	25 %	50 %	0 %	25 %	379739911
35	NC_016944	T	6	6	2289	2294	0 %	100 %	0 %	0 %	379739911
36	NC_016944	ACCA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	0 %	50 %	379739911
37	NC_016944	GAA	3	9	2385	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739911
38	NC_016944	TCT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739911
39	NC_016944	TCT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739911
40	NC_016944	CAG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739911
41	NC_016944	GTA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739911
42	NC_016944	CCAA	2	8	2541	2548	50 %	0 %	0 %	50 %	379739911
43	NC_016944	CTTTCT	2	12	2654	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739911
44	NC_016944	CAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739911
45	NC_016944	ATC	2	6	2703	2708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739911
46	NC_016944	GCA	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739911
47	NC_016944	CAC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739911
48	NC_016944	GAT	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739911
49	NC_016944	CAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739911
50	NC_016944	CAGTG	2	10	2878	2887	20 %	20 %	40 %	20 %	379739911
51	NC_016944	CAAC	2	8	2904	2911	50 %	0 %	0 %	50 %	379739911
52	NC_016944	ACC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739911
53	NC_016944	TTTG	2	8	3024	3031	0 %	75 %	25 %	0 %	379739911
54	NC_016944	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739911
55	NC_016944	TCA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739911
56	NC_016944	AGT	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739911
57	NC_016944	ATC	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739911
58	NC_016944	GTC	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739911
59	NC_016944	CTT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739911
60	NC_016944	CAC	3	9	3239	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739911
61	NC_016944	CCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739911
62	NC_016944	CAG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739911
63	NC_016944	CATA	2	8	3305	3312	50 %	25 %	0 %	25 %	379739911
64	NC_016944	ATT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739911
65	NC_016944	CACT	2	8	3479	3486	25 %	25 %	0 %	50 %	379739911
66	NC_016944	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739911
67	NC_016944	CAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739911
68	NC_016944	CGC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739911
69	NC_016944	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739911
70	NC_016944	AGGAGC	2	12	3759	3770	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	379739911
71	NC_016944	CTG	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739911
72	NC_016944	TTC	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739911
73	NC_016944	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739911
74	NC_016944	GAAA	2	8	3846	3853	75 %	0 %	25 %	0 %	379739911
75	NC_016944	TTAT	2	8	3899	3906	25 %	75 %	0 %	0 %	379739912
76	NC_016944	TGG	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739912
77	NC_016944	TGG	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739912
78	NC_016944	TAA	2	6	4087	4092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379739912
79	NC_016944	GA	3	6	4140	4145	50 %	0 %	50 %	0 %	379739912
80	NC_016944	CAAG	2	8	4164	4171	50 %	0 %	25 %	25 %	379739913
81	NC_016944	TTC	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739913
82	NC_016944	GC	3	6	4200	4205	0 %	0 %	50 %	50 %	379739913
83	NC_016944	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739913
84	NC_016944	TTA	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739913
85	NC_016944	GCGA	2	8	4366	4373	25 %	0 %	50 %	25 %	379739913
86	NC_016944	GAG	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379739913
87	NC_016944	CGTA	2	8	4467	4474	25 %	25 %	25 %	25 %	379739913
88	NC_016944	ATT	2	6	4491	4496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739914
89	NC_016944	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739914
90	NC_016944	ATG	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739914
91	NC_016944	TTGA	2	8	4886	4893	25 %	50 %	25 %	0 %	379739915
92	NC_016944	CTT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739915
93	NC_016944	ACC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739915
94	NC_016944	T	6	6	5057	5062	0 %	100 %	0 %	0 %	379739915
95	NC_016944	CACC	2	8	5080	5087	25 %	0 %	0 %	75 %	379739915
96	NC_016944	CAG	3	9	5123	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739915
97	NC_016944	CG	3	6	5150	5155	0 %	0 %	50 %	50 %	379739915
98	NC_016944	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739915
99	NC_016944	GCC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739915
100	NC_016944	AG	3	6	5186	5191	50 %	0 %	50 %	0 %	379739915
101	NC_016944	TGC	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739915
102	NC_016944	ATC	2	6	5231	5236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739915
103	NC_016944	T	6	6	5270	5275	0 %	100 %	0 %	0 %	379739915
104	NC_016944	CG	3	6	5316	5321	0 %	0 %	50 %	50 %	379739915
105	NC_016944	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739915
106	NC_016944	CGCAG	2	10	5470	5479	20 %	0 %	40 %	40 %	379739915
107	NC_016944	GAT	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739915
108	NC_016944	TC	3	6	5524	5529	0 %	50 %	0 %	50 %	379739915
109	NC_016944	ATC	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739915
110	NC_016944	TCTGC	2	10	5631	5640	0 %	40 %	20 %	40 %	379739916
111	NC_016944	ACC	3	9	5669	5677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739916
112	NC_016944	AAG	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739916
113	NC_016944	A	6	6	5711	5716	100 %	0 %	0 %	0 %	379739916
114	NC_016944	GAGG	2	8	5782	5789	25 %	0 %	75 %	0 %	379739916
115	NC_016944	TTGAT	2	10	5790	5799	20 %	60 %	20 %	0 %	379739916
116	NC_016944	TCA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739916
117	NC_016944	GAT	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739916
118	NC_016944	CAAC	2	8	6018	6025	50 %	0 %	0 %	50 %	379739916
119	NC_016944	GTA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739916
120	NC_016944	AGC	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739916
121	NC_016944	A	6	6	6092	6097	100 %	0 %	0 %	0 %	379739916
122	NC_016944	GCA	2	6	6240	6245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739916
123	NC_016944	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739917
124	NC_016944	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739917
125	NC_016944	CAGA	2	8	6560	6567	50 %	0 %	25 %	25 %	379739917
126	NC_016944	ATCA	2	8	6777	6784	50 %	25 %	0 %	25 %	379739917
127	NC_016944	CA	3	6	6946	6951	50 %	0 %	0 %	50 %	379739917
128	NC_016944	AGA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739917
129	NC_016944	CTG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739918
130	NC_016944	ATG	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739918
131	NC_016944	GCC	2	6	7650	7655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739918
132	NC_016944	TGG	2	6	7659	7664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739918
133	NC_016944	GTAC	2	8	7682	7689	25 %	25 %	25 %	25 %	379739918
134	NC_016944	CGG	2	6	7704	7709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739918
135	NC_016944	TCG	2	6	7712	7717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739918
136	NC_016944	GAT	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739918
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139	NC_016944	GCG	2	6	7898	7903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739918
140	NC_016944	GGC	2	6	7925	7930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739918
141	NC_016944	TGC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739918
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164	NC_016944	CGTG	2	8	8485	8492	0 %	25 %	50 %	25 %	379739918
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256	NC_016944	AAG	2	6	13024	13029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739921
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259	NC_016944	TTGA	2	8	13203	13210	25 %	50 %	25 %	0 %	379739921
260	NC_016944	GTG	2	6	13231	13236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739921
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264	NC_016944	GTCT	2	8	13303	13310	0 %	50 %	25 %	25 %	379739921
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